Я уже писал в недавней статье об оптимизации базы данных через phpMyAdmin. Это не занимет много времени. Однако при наличии нескольких проектов все же важна каждая минута. Поэтому для ускорения процесса можно автоматизировать работу по оптимизации, воспользовавшись для этого расширением WP-Optimize. Тем более, что он не заберет много ресурсов сайта, потому что после проведения оптимизации его можно деактивировать до следующего раза. Читайте далее о
плагине WP-Optimize